Ingénieur·e d’étude – Gestion des Challenges FBI

À propos du poste

France-BioImaging recrute un·e ingénieur·e d’étude pour piloter les Challenges FBI, une compétition de machine learning en bioimagerie. Le poste, rattaché au nœud transverse « Image Processing and Data Management », est basé à Montpellier au sein du LIRMM.

Missions principales

• Participer à la conception et au pilotage des challenges scientifiques en lien avec la communauté.
• Formaliser les objectifs, les spécifications de données et les critères d’évaluation.
• Coordonner la collecte, le contrôle qualité, l’annotation et la standardisation des jeux de données selon les principes FAIR.
• Développer et administrer les plateformes de soumission, d’évaluation et les API associées.
• Animer la communauté, organiser réunions, webinaires et promouvoir les challenges.
• Assurer le support technique aux utilisateurs et garantir la sécurité et la disponibilité des services.
• Analyser les résultats, établir des classements et contribuer à la rédaction d’articles scientifiques.

Profil recherché

• Formation supérieure en informatique, bioinformatique ou domaine connexe.
• Expérience en gestion et structuration de données scientifiques, maîtrise des principes FAIR.
• Bonne connaissance des bases de données, métadonnées et des standards de la bioimagerie.
• Capacité à travailler en équipe pluridisciplinaire et à communiquer avec la communauté scientifique.

Compétences requises

• Gestion de bases de données et métadonnées (SQL, NoSQL).
• Développement d’applications web et d’API (Python, Java, JavaScript).
• Administration de systèmes d’information et hébergement de services.
• Connaissances des standards FAIR et des protocoles d’acquisition d’images.
• Utilisation d’outils de versionning et de déploiement (Git, Docker).