Ingénieur·e de recherche scientifique en bioinformatique

À propos du poste

Nous recherchons un·e ingénieur·e en bioinformatique pour rejoindre un projet de recherche portant sur le pan‑génome de la microalgue marine Bathycoccus prasinos. Vous intégrerez une équipe pluridisciplinaire afin d’analyser la structure des populations et les mécanismes d’adaptation dans les océans.

Missions principales

• Assembler les données de séquençage issues de la technologie Oxford Nanopore pour une collection d’environ 150 génomes.
• Intégrer les génomes assemblés dans des outils d’analyse et de visualisation du pan‑génome.
• Identifier des marqueurs d’insertion/délétions spécifiques aux différentes populations.
• Cartographier ces marqueurs sur des jeux de données métagénomiques et métatranscriptomiques environnementales à l’échelle mondiale.

Profil recherché

• Ingénieur·e (H/F) spécialisé·e en bioinformatique.

Compétences requises

• Maîtrise du séquençage Oxford Nanopore et de l’assemblage de génomes.
• Expérience en analyse de pan‑génome et visualisation de données génomiques.
• Capacité à identifier et analyser des marqueurs d’insertion/délétions.
• Compétences en traitement de données métagénomiques et métatranscriptomiques.